Le jeune Jesse vit toujours auprès de ses parents adoptifs, les Greenwood. Après la mort brutale de sa mère, son demi-frère rejoint lui aussi la petite famille. Les deux enfants ont du mal à s'entendre mais Jesse va bientôt trouver mieux à faire que se quereller. En effet, il tombe amoureux et retrouve l'orque Willy qu'il doit sauver d'un grand danger causé par les opérations illicites d'une compagnie pétrolière.